Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccne2Q9Z238 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccne2Q9Z238 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms