Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Clic1Q9Z1Q5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Clic1Q9Z1Q5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms