Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shcbp1Q9Z179 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms