Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sumo3Q9Z172 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sumo3Q9Z172 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms