Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cpne6Q9Z140 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cpne6Q9Z140 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms