Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Sema4fQ9Z123 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms