Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup160Q9Z0W3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup160Q9Z0W3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup160Q9Z0W3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nup160Q9Z0W3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nup160Q9Z0W3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup160Q9Z0W3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup160Q9Z0W3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup160Q9Z0W3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup160Q9Z0W3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup160Q9Z0W3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup160Q9Z0W3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup160Q9Z0W3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup160Q9Z0W3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup160Q9Z0W3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup160Q9Z0W3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup160Q9Z0W3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup160Q9Z0W3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup160Q9Z0W3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup160Q9Z0W3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup160Q9Z0W3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup160Q9Z0W3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nup160Q9Z0W3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms