Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cdh20Q9Z0M3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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