Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I6

Slfn2, Schlafen 2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn2Q9Z0I6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slfn2Q9Z0I6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn2Q9Z0I6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms