Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcn5Q9WVD4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms