Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stxbp4Q9WV89 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms