Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nme3Q9WV85 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme3Q9WV85 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms