Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pus1Q9WU56 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pus1Q9WU56 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pus1Q9WU56 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Pus1Q9WU56 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pus1Q9WU56 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Pus1Q9WU56 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pus1Q9WU56 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus1Q9WU56 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus1Q9WU56 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus1Q9WU56 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus1Q9WU56 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus1Q9WU56 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus1Q9WU56 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus1Q9WU56 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus1Q9WU56 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus1Q9WU56 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus1Q9WU56 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus1Q9WU56 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pus1Q9WU56 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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