Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ptpn4Q9WU22 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms