Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh13Q9WTR5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdh13Q9WTR5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms