Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trpv2Q9WTR1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms