Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PplQ9R269 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PplQ9R269 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PplQ9R269 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PplQ9R269 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PplQ9R269 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PplQ9R269 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PplQ9R269 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PplQ9R269 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PplQ9R269 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PplQ9R269 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PplQ9R269 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PplQ9R269 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PplQ9R269 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PplQ9R269 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PplQ9R269 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PplQ9R269 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PplQ9R269 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PplQ9R269 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PplQ9R269 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PplQ9R269 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PplQ9R269 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PplQ9R269 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PplQ9R269 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PplQ9R269 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PplQ9R269 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PplQ9R269 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PplQ9R269 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PplQ9R269 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PplQ9R269 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PplQ9R269 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PplQ9R269 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PplQ9R269 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PplQ9R269 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PplQ9R269 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PplQ9R269 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PplQ9R269 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PplQ9R269 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PplQ9R269 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PplQ9R269 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PplQ9R269 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PplQ9R269 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PplQ9R269 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PplQ9R269 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PplQ9R269 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms