Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc2Q9R244 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc2Q9R244 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms