Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sorbs3Q9R1Z8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sorbs3Q9R1Z8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms