Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp6ap1Q9R1Q9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atp6ap1Q9R1Q9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms