Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmed2Q9R0Q3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms