Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod3Q9R0E1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod3Q9R0E1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms