Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nek3Q9R0A5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nek3Q9R0A5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms