Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf11Q9QYK7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf11Q9QYK7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms