Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nufip1Q9QXX8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nufip1Q9QXX8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms