Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx8Q9QXV1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx8Q9QXV1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms