Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trp53inp1Q9QXE4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms