Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cln8Q9QUK3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Cln8Q9QUK3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms