Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PolkQ9QUG2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PolkQ9QUG2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms