Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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