Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfmbt1Q9JMD1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms