Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM61

Thsd1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 851 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd1Q9JM61 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Thsd1Q9JM61 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Thsd1Q9JM61 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Thsd1Q9JM61 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Thsd1Q9JM61 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Thsd1Q9JM61 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Thsd1Q9JM61 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Thsd1Q9JM61 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Thsd1Q9JM61 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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