Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Col5a3Q9JLI2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col5a3Q9JLI2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms