Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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Tlr5Q9JLF7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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Tlr5Q9JLF7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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Tlr5Q9JLF7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tlr5Q9JLF7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms