Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SacsQ9JLC8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
SacsQ9JLC8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SacsQ9JLC8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SacsQ9JLC8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SacsQ9JLC8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SacsQ9JLC8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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SacsQ9JLC8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SacsQ9JLC8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
SacsQ9JLC8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
SacsQ9JLC8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
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SacsQ9JLC8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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SacsQ9JLC8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
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SacsQ9JLC8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
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SacsQ9JLC8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
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SacsQ9JLC8 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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SacsQ9JLC8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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SacsQ9JLC8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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SacsQ9JLC8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SacsQ9JLC8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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