Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rfx5Q9JL61 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfx5Q9JL61 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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