Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Upk3aQ9JKX8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms