Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mrpl39Q9JKF7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms