Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nectin1Q9JKF6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms