Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scamp5Q9JKD3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Scamp5Q9JKD3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms