Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ybx3Q9JKB3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ybx3Q9JKB3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms