Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddx20Q9JJY4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ddx20Q9JJY4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms