Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smpd3Q9JJY3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smpd3Q9JJY3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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