Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc22Q9JIG7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc22Q9JIG7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms