Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Tmod3Q9JHJ0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Tmod3Q9JHJ0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Tmod3Q9JHJ0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Tmod3Q9JHJ0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Tmod3Q9JHJ0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Tmod3Q9JHJ0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Tmod3Q9JHJ0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Tmod3Q9JHJ0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Tmod3Q9JHJ0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Tmod3Q9JHJ0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Tmod3Q9JHJ0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Tmod3Q9JHJ0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Tmod3Q9JHJ0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Tmod3Q9JHJ0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod3Q9JHJ0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms