Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rb1cc1Q9ESK9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rb1cc1Q9ESK9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rb1cc1Q9ESK9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms