Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OtofQ9ESF1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OtofQ9ESF1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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