Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Usp29Q9ES63 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp29Q9ES63 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Usp29Q9ES63 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Usp29Q9ES63 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Usp29Q9ES63 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp29Q9ES63 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp29Q9ES63 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp29Q9ES63 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp29Q9ES63 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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