Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chrnb2Q9ERK7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms