Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc28a3Q9ERH8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms